Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trappc6bQ9D289 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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