Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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