Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gins3Q9CY94 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms