Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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