Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atg12Q9CQY1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.7 ms