Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Use1Q9CQ56 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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