Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rtn4rQ99PI8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rtn4rQ99PI8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rtn4rQ99PI8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rtn4rQ99PI8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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