Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Def8Q99J78 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Def8Q99J78 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms