Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sf3b5Q923D4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b5Q923D4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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