Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rhbdd2Q8VEK2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rhbdd2Q8VEK2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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