Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Stx18Q8VDS8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Stx18Q8VDS8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Stx18Q8VDS8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Stx18Q8VDS8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Stx18Q8VDS8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Stx18Q8VDS8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Stx18Q8VDS8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms