Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Hoxc12Q8K5B8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Hoxc12Q8K5B8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Hoxc12Q8K5B8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxc12Q8K5B8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Hoxc12Q8K5B8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Hoxc12Q8K5B8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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