Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Abcf3Q8K268 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Abcf3Q8K268 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Abcf3Q8K268 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Abcf3Q8K268 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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