Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd300eQ8K249 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd300eQ8K249 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd300eQ8K249 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd300eQ8K249 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd300eQ8K249 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd300eQ8K249 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd300eQ8K249 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms