Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim68Q8K243 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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