Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Klf17Q8CFA7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Klf17Q8CFA7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms