Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp27Q8CEG8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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