Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef8Q8CE24 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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