Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ss18l1Q8BW22 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ss18l1Q8BW22 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ss18l1Q8BW22 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ss18l1Q8BW22 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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