Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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