Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Clec18aQ7TSQ1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Clec18aQ7TSQ1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Clec18aQ7TSQ1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Clec18aQ7TSQ1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Clec18aQ7TSQ1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Clec18aQ7TSQ1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Clec18aQ7TSQ1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Clec18aQ7TSQ1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms