Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ssx9Q6XAS3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms