Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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