Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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Q6DFW0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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Q6DFW0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q6DFW0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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