Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm5dQ62240 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms