Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
JrkQ60976 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
JrkQ60976 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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JrkQ60976 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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