Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Lrrc43Q3V0L5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Lrrc43Q3V0L5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Lrrc43Q3V0L5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Lrrc43Q3V0L5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Lrrc43Q3V0L5 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Lrrc43Q3V0L5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc43Q3V0L5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms