Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms