Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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D13Ertd608eQ3UPR8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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