Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Prl3a1-201ENSMUST00000049463 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gtpbp6Q3U6U5 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Myl1-201ENSMUST00000027151 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp6Q3U6U5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms