Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms