Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hdgfl1Q2VPR5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hdgfl1Q2VPR5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hdgfl1Q2VPR5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hdgfl1Q2VPR5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hdgfl1Q2VPR5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hdgfl1Q2VPR5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hdgfl1Q2VPR5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hdgfl1Q2VPR5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hdgfl1Q2VPR5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hdgfl1Q2VPR5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hdgfl1Q2VPR5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdgfl1Q2VPR5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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