Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NfiaQ02780 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms