Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms