Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mesp1P97309 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms