Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms