Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
UbdP63072 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
UbdP63072 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
UbdP63072 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
UbdP63072 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms