Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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