Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms