Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp25P57080 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp25P57080 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms