Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Cldn18P56857 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn18P56857 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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