Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp1P55194 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms