Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Kng2-201ENSMUST00000039338 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rplp1P47955 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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