Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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