Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxd10P28359 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxd10P28359 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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