Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Hoxb1P17919 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Hoxb1P17919 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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