Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms