Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms