Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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