Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms